Комиссия осуществляет свою деятельность в соответствии с регламентом, который утверждается на заседании комиссии и подписывается ее председателем. Порядок работы комиссии по отдельным вопросам определяется ее председателем. Организационно-техническое и информационно-аналитическое обеспечение деятельности комиссии осуществляется Министерством финансов Российской Федерации.